Предыдущая часть фантастического боевика «Бегущий в лабиринте: Испытание огнем»(2015) рассказывается о том, как группа молодых ребят жили несколько лет в лабиринте, который стал для них настоящим испытанием. Они прошли его, рискуя жизнями. Ежемесячно к ним попадал новый парень, который тоже становился жертвой лабиринта. 

Никто из ребят ничего о себе не помнит, ни кто они, откуда они, есть ли у них семья. Они не понимают, зачем они здесь, и никто им не может объяснить этого. Они знают только то, как их зовут. Наиболее храбрые и отчаянные из них начинают борьбу со сложным испытанием, на это раз это движущиеся стены лабиринта, в которых существует где-то страшный монстр. Никто из предыдущих жертв лабиринта не смог пройти сложное испытание и выбраться отсюда. Но когда к парням попадает девочка, все кардинально меняется. Трем ребятам, включая девушку, удается спастись из лап лабиринта, убежать отсюда. Но, когда казалось бы, все препятствия и испытания позади, молодым людям предстоит очередная опасность. На сей раз, изощренные и злобные представители организации Порок придумали очередное испытание. Ребят перебрасывают в раскаленную пустыню, которая таит в себе более весомую опасность, нежели предыдущая гонка. Здесь обитают полулюди-полумонстры, которые больны неизвестной болезнью и, к тому же, заразны. Им нельзя доверять, нельзя вступать в контакт, они чересчур агрессивны и ведут себя более чем странно. 

Ребятам предстоит пройти по раскаленному песку, испытать голод, жажду, опасность. Здесь их ждет опасность на каждом шагу и нужно остерегаться даже своей тени. Данные существа переносят какой-то неизведанный науке вирус, который мутировал и превратил их в нездоровых, агрессивных и неадекватных представителей пустынного мира. 

Смогут ли ребята пройти сквозь пустыню, победить все опасность на своем пути и вернуться домой, к своим родным, пока остается загадкой. Остается загадкой и то, по какому принципу проводился отбор персонажей для столь опасных для жизни игр и каково истинные цели злобной и жестокой организации.